Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zcchc4Q8BKW4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms