Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg4dQ8BGV9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg4dQ8BGV9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms