Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SynprQ8BGN8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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