Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Best2Q8BGM5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms