Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8BGC1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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