Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms