Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms