Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubp1Q811S7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubp1Q811S7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ubp1Q811S7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ubp1Q811S7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ubp1Q811S7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ubp1Q811S7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ubp1Q811S7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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