Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc50Q810U5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms