Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChfrQ810L3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChfrQ810L3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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