Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo1Q80ZD8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms