Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NanogQ80Z64 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NanogQ80Z64 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NanogQ80Z64 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NanogQ80Z64 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NanogQ80Z64 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NanogQ80Z64 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NanogQ80Z64 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NanogQ80Z64 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NanogQ80Z64 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NanogQ80Z64 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NanogQ80Z64 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NanogQ80Z64 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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