Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms