Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbbp8Q80YR6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms