Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pcsk9Q80W65 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pcsk9Q80W65 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pcsk9Q80W65 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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