Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms