Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sestd1Q80UK0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sestd1Q80UK0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sestd1Q80UK0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sestd1Q80UK0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sestd1Q80UK0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sestd1Q80UK0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sestd1Q80UK0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sestd1Q80UK0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sestd1Q80UK0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms