Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms