Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul9Q80TT8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul9Q80TT8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms