Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cdc42bpbQ7TT50 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc42bpbQ7TT50 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms