Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo1Q7TT28 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo1Q7TT28 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms