Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2q1Q7TSS2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms