Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdp1Q7TSG2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms