Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prrc2bQ7TPM1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms