Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Mycbp2Q7TPH6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Mycbp2Q7TPH6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms