Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shq1Q7TMX5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shq1Q7TMX5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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