Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg4Q7TMD7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg4Q7TMD7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms