Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Scn4bQ7M729 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn4bQ7M729 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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