Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brd2Q7JJ13 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms