Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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