Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Trappc6aQ78XR0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trappc6aQ78XR0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trappc6aQ78XR0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trappc6aQ78XR0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trappc6aQ78XR0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc6aQ78XR0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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