Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim12Q78RX3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim12Q78RX3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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