Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rph3alQ768S4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rph3alQ768S4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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