Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms