Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SpopQ6ZWS8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SpopQ6ZWS8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms