Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Topbp1Q6ZQF0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Topbp1Q6ZQF0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms