Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80Q6ZPV2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms