Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssxb3Q6XAS4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ssxb3Q6XAS4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ssxb3Q6XAS4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ssxb3Q6XAS4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ssxb3Q6XAS4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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