Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc44a1Q6X893 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc44a1Q6X893 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms