Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms