Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms