Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Timd4Q6U7R4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Timd4Q6U7R4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms