Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms