Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gja6Q6S5G4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms