Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms