Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc82Q6PG04 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc82Q6PG04 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms