Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad54bQ6PFE3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms