Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gramd2bQ6PEM6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gramd2bQ6PEM6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms