Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Taf1cQ6PDZ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms