Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms